To, co Zakynthos ma do zaoferowania, to niezwykłe bogactwo naturalne: poprzecinane skałami wybrzeże, potężne klify, piaszczyste plaże i wydmy, a także wyjątkowa fauna i flora. Pod tym względem miejscem szczególnym jest południowa część wyspy. Od Półwyspu Marathonisi do Plaży Gerakas rozciąga się teren chroniony Morskiego Parku Narodowego. Powstał w celu ochrony żyjących na wyspie zwierząt, przede wszystkim żółwi Caretta caretta i fok Monachus-Monachus, ale też dzikich łabędzi, jaskółek, żab, węży wodnych.
Błękitne Groty są jedną z czołowych atrakcji Zakynthos. Tajemnicze jaskinie, w których krystalicznie czysta morska woda mieni się w słońcu różnymi kolorami budzą zachwyt turystów. Leżą na wschodnim wybrzeżu wyspy, między miejscowościami Skinari i Agios Nikolaos. Są dostępne wyłącznie od strony wody. Grecy znaleźli na to sposób i organizują rejsy do grot, m.in. ze: Skinari i Agios Nikolaos. Udaj się tam motorówką, aby dokładnie przyjrzeć się niesamowitym grotom, a nawet dnu morza. Rejs można połączyć ze zwiedzaniem Zatoki Wraku.
Porto Limnionas to niewielka, kamienista zatoka na zachodnim brzegu Zakynthos. Tworzy ją zielono-błękitna, czysta woda wdzierająca się wąskim przesmykiem pomiędzy nagie skały. Prowadzi do niej stroma, wąska droga. Co odważniejsi turyści pomijają ten etap i skaczą do morza bezpośrednio ze skał. Porto Limnionas nie zachęca do plażowania. Ostre kamienie na brzegu i fale utrudniają wejście do wody. Pomimo to miejsce cieszy się dużą popularnością. Niedaleko znajdują się niewielkie groty, przez które da się przepłynąć. Do Porto Limnionas można dotrzeć z oddalonej o niecałe 6 km miejscowości Agios Leon.
Przylądek Keri jest najdalej wysuniętym na południe punktem Zakynthos. Od morza oddzielają go potężne masywne klify. Turyści licznie tam przyjeżdżają, aby obejrzeć dwie skały, wyrastające z morza. Są one widoczne wyłącznie z punktu widokowego w tawernie przy latarni morskiej. Aby móc się do niego dostać, trzeba oczywiście złożyć zamówienie, ale trudno żałować wydatku na wyśmienite greckie jedzenie.
Na południowo-zachodnim brzegu Półwyspu Keri znajdują się Groty Keri (lub Marathia, określane tak od nazwy miejscowości, która znajduje się niedaleko nich). To jaskinie wydrążone w klifach. Można do nich dotrzeć wyłącznie od strony morza, podczas rejsu z Laganas, Agios Sostis lub Limni Keriou. Są mniejsze od Błękitnych Grot, przez co cieszą się również mniejszą popularnością. Nie oznacza to jednak, że nie są równie spektakularne.
Rejs do Grot Keri można połączyć z wyprawą na pobliską wysepkę Marathonisi. Jej kształt przypominający żółwią skorupę oraz duża populacja żółwi Caretta caretta sprawiły, że cieszy się ona mianem Żółwiej Wyspy. Skalista i niezamieszkana przez człowieka cieszy się urokliwymi plażami i skalistymi zatokami. Na wyspę można dopłynąć również samemu wypożyczoną łodzią.
Wizyta w tej tradycyjnej wiosce na Zakynthos to propozycja dla poszukiwaczy ciekawych perełek przyrodniczych. W tym miejscu nieprzerwanie od ponad 2000 lat rośnie najstarsze drzewo oliwne na wyspie. Wydaje się suche i poskręcane od starości, ale w środku wciąż jest pełne życia, co daje po sobie poznać, wydając kolejne owoce. Przy okazji pobytu w Exo Horze warto przejść się jej urokliwymi uliczkami i zatrzymać w kawiarence, aby wypróbować tamtejsze nalewki. Do wioski można dojechać autobusem z miasta Zakynthos lub samochodem.